פרופסור לכלכלה עירונית ואזורית ומחזיק הקתדרה לתכנון ערים ואזורים ע"ש לוננפלד קוני בפקולטה לארכיטקטורה ובינוי ערים בטכניון. שפר מתמחה כלכלה עירונית ואזורית, כלכלת ותכנון תחבורה, כלכלת סביבה ושיטות כמותיות בתכנון. פרסם מספר ספרים, דוחות מדעיים ועשרות מאמרים בתחום התכנון העירוני, כלכלה עירונית ואזורית וכלכלת תחבורה וסביבה, שהתפרסמו בכתבי עת בינלאומיים ויוקרתיים.
